โปรโตคอลทำให้ฟังก์ชั่นเครือข่ายเหล่านี้เป็นไปได้ ตัวอย่างเช่น Internet Protocol (IP) มีหน้าที่กำหนดเส้นทางข้อมูลโดยระบุว่าแพ็กเก็ตข้อมูล * มาจากไหนและ โพรโทคอล ปลายทางคืออะไร IP ทำให้การสื่อสารระหว่างเครือข่ายเป็นไปได้ ดังนั้น IP จึงถือเป็น โปรโตคอล เครือข่ายเลเยอร์ (เลเยอร์ 3) อีกตัวอย่างหนึ่งTransmission Control Protocol (TCP)ช่วยให้มั่นใจได้ว่าการขนส่งแพ็กเก็ตข้อมูลข้ามเครือข่ายเป็นไปอย่างราบรื่น ดังนั้น TCP จึงถือเป็นโปรโตคอลการขนส่งเลเยอร์ตามที่อธิบายไว้ข้างต้น IP เป็นโปรโตคอลเลเยอร์เครือข่ายที่รับผิดชอบในการกำหนดเส้นทาง แต่ไม่ใช่โปรโตคอลเลเยอร์เครือข่ายเดียว IPsec Internet Protocol Security (IPsec) ตั้งค่าการเชื่อมต่อ IP ที่เข้ารหัสและรับรองความถูกต้องผ่านเครือข่ายส่วนตัวเสมือน (VPN) ในทางเทคนิคแล้ว IPsec ไม่ใช่โปรโตคอล แต่เป็นชุดของโปรโตคอลที่มี Encapsulating Security Protocol (ESP), Authentication Header (AH) และ Security Associations (SA)